El origen de la población se remonta al siglo XV , cuando se funda como mayorazgo de don Fernando Páez de Castillejo y doña Leonor de Angulo, que fueron facultados por los Reyes Católicos en 1495 para crear éste en favor de su hijo mayor Francisco Páez de Castillejo, del que formaron parte las tierras y ventas de la Alhondiguilla (actual Villaharta) que se poblaron hacia 1630 cuando Don Diego Páez de Castillejo compró al rey, por cinco mil ducados, la jurisdicción civil y criminal, construyéndose poco después la iglesia y la posada. Por sucesivas transmisiones hereditarias llegó la villa a posesión de la casa de Alba, a través de don Fernando de Silva Alvarez de Toledo, duque de Alba y marques de El Carpio, que fue duodécimo señor de Villaharta Las aguas mineromedicinales de Villaharta, suministradas por los manantiales de Fuente Agria, disfrutaron en épocas pasadas de fama internacional