La zona en la que se enclava Cortes de Baza fue ha sido asentamiento humano desde la Prehistoria como demuestran los numerosos yacimientos encontrados en todo el paraje conocido como Hoya de Baza y que en este caso resultan procedentes de muy diversas culturas: una mandíbula de mamut, cuencos argáricos y objetos varios de poblados iberos, fenicios y romanos, todo lo cual fue a parar a Madrid para su estudio y catalogación sin retorno de momento al pueblo. Tuvo una etapa de esplendor desde la época romana hasta el final de la dominación musulmana y decayó tras la represión que siguió a la rebelión de los moriscos. Desde siempre ha estado muy vinculada a la comarca bastetana y hoy quiere despegar de nuevo gracias a las posibilidades que ofrece para el turismo rural con sus numerosas y bien acondicionadas viviendas-cueva en casi todos los anejos.