Se le denomina Bollullos par del Condado porque históricamente no perteneció al Condado de la Niebla. La Villa de Bollullos fue señorío de los Duques de Medina Sidonia. De ahí lo de par que tiene la significación de estar a la altura o estar al lado de... Poco se sabe con certeza de los orígenes de Bollullos, aunque en su término se han encontrado vestigios y restos de la Edad de Piedra (hachas de silex) y de la Edad del Bronce (un ídolo que hoy se encuentra en el Museo Arqueológico de Madrid). Se cree que el nombre de Bulbuca era la primera referencia que existe de un poblado romano por estas cercanías y éste pudiera ser el primer grupo vecinal sobre el que se asentaron los que vinieron después. Romana es la columna que sostiene el crucero de la explanada que hay en la Ermita así como la columna sobre la que se sitúa la Virgen de las Mercedes. Ambas columnas fueron encontradas cuando se hacían los cimientos de lo que hoy es el Templo, situado a unos dos kilómetros del actual núcleo de población de Bollullos par del Condado. Esas primeras civilizaciones son las que parecen ser recordadas, en el escudo de la localidad, mediante una pica con un bollo hincado en la punta y una honda de los antiguos honderos (Antequera Luengo, Juan José: 'Empresas simbólicas de Bollullos Par del Condado. Vexilología. Sigilografía. Heráldica'; Sevilla, Facediciones, 2008). Tampoco han faltado en los campos que rodean al pueblo vestigios de la dominación árabe. No es difícil pensar que debido a las condiciones naturales de este término (clima, vegetación, tierra), existiesen poblamientos desde los tiempos más antiguos. Los datos más fidedignos nos hablan de que en el siglo XV había en el término municipal de Bollullos par del Condado varios asentamientos humanos, uno situado en los alrededores del convento Franciscano de San Juan de Morañina y otros en los lugares que se conocen con los nombres de Marchenilla, Reyerta, Villares y Cabezo de Santiago. La peste, tan temida por aquellos tiempos, fue la causante de que estos asentamientos, sin conexión entre ellos, abandonaran sus antiguos lugares y confluyeran donde hoy se encuentra la actual población. Los primeros datos del número de habitantes de esta ciudad se remontan al siglo XVII, (año 1645) donde se habla de la existencia de tres mil habitantes que vivían fundamentalmente del pan, el aceite y el vino. Durante los siglos XVII, XVIII y XIX la población de Bollullos sufrió constantes altibajos. No es hasta finales del siglo XIX y comienzos del XX cuando la población experimentó un auge espectacular, debido fundamentalmente a que el negocio del vino tomó forma y carácter, muy influenciado todo ello con la llegada de los comerciantes riojanos. Desde entonces, el vino sería el principal exponente económico de Bollullos par del Condado. De ahí, que posea la mayor cooperativa vinícola de Andalucía y que más del 50 por ciento de su territorio esté ocupado por viñas.
El libro 'Expedientes carcelarios de Bollullos Par del Condado (Huelva). Prisión Provincial, 1936-1939' (Facediciones, 2008), de Juan José Antequera Luengo y Juan José Luengo Jiménez, da cuenta de cuantos vecinos sufrieron prisión durante la guerra civil española.